Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2019 m. sausio 21 d. įsakymu Nr. V-9 (2022 m. gegužės 16 d. įsakymo Nr. V- 52 redakcija) patvirtintas valstybės įsteigtų saugomų teritorijų, neturinčių direkcijų, ir Europos ekologinio tinklo "Natura 2000" teritorijų, nepatenkančių į valstybinius parkus, rezervatus ar biosferos rezervatą, priskyrimo saugomų teritorijų direkcijoms sąrašas.
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2016 m. gegužės 16 d. įsakymu Nr. V- 96 patvirtintas valstybinių gamtinių rezervatų, valstybinių parkų ir biosferos rezervato direkcijų funkcijų vykdymas priskirtose teritorijose.
Europos ekologinio tinklo Natura 2000 teritorijų, svarbių buveinių ir paukščių apsaugai, sąrašai
Valstybinė saugomų teritorijų tarnyba prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2017-01-16 įsakymu Nr. V-4 patvirtino Valstybinių parkų kraštovaizdžio analizės ir jo suvokimo didinimo tikslinę programą. Programos tikslas – stiprinti valstybinių parkų kraštovaizdžio svarbos, išskirtinės vertės suvokimą, palengvinti apsaugos ir tvarkymo priemonių planavimo procesą, sudaryti sąlygas padidinti planavimo dokumentų kokybę, prisidėti prie informacijos sklaidos.
Programos uždaviniai orientuoti į valstybinių parkų išskirtinės vertės suvokimo didinimą ir jo išsaugojimą, kraštovaizdžio sampratos populiarinimą (pristatyti, kokiam kraštovaizdžio tipui/tipams išsaugoti įsteigtas valstybinis parkas, kaip susiformavo jo kraštovaizdis, kokie procesai vyko ir vyksta šiuo metu). Įgyvendinant Programą bus siekiama sudaryti prielaidas apsaugos ir tvarkymo priemonėms valstybiniuose parkuose numatyti (rengiant teritorijų planavimo ar kitus dokumentus) ir įgyvendinti, prisidėti prie geoekologinių, kultūrinių bei rekreacinių kraštovaizdžio funkcijų stiprinimo.
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2016 m. vasario 26 d. įsakymu Nr. V-16 patvirtintos Europos Bendrijos svarbos rūšių monitoringo metodikos.
(Įsakymo priedai – Europos bendrijos svarbos paukščių rūšių monitoringo metodikos, Europos Bendrijos svarbos žinduolių, žuvų, varliagyvių, roplių, moliuskų, vabzdžių ir augalų rūšių metodikos)
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos supaprastintų viešųjų pirkimų taisyklės, patvirtintos Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2013 m. balandžio 24 d. įsakymu Nr. V-97.
Viešųjų pirkimų organizavimo Valstybinėje saugomų teritorijų tarnyboje prie Aplinkos ministerijos taisyklės, patvirtintos Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2013 m. balandžio 24 d.įsakymu Nr. V-97.
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2012 m. kovo 22 d. įsakymu Nr. V-64 patvirtintas Pažymos apie leidimą miškui įveisti „Natura 2000“ teritorijoje išdavimo tvarkos aprašas (įsakymas, aprašas). Priedai: pažymos forma, vertinimo ataskaita.
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2011 m. spalio 14 d. įsakymu Nr. V-255 patvirtintas Tarnybos darbuotojų elgesio kodeksas.
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2010 m. vasario 24 d. įsakymu Nr. V-50 (Tarnybos direktoriaus 2018 m. sausio 4 d. įsakymo Nr. V-2 redakcija) patvirtintos Tarnybos vidaus tvarkos taisyklės.
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2009 m. gruodžio 23 d. įsakymu Nr. V228 patvirtintas Lietuvos Respublikos saugomų teritorijų valstybės kadastro įrašų peržiūros procedūros aprašas
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2018 m. birželio 20 d. įsakymu Nr. V-170 patvirtintas Lietuvos Respublikos saugomų teritorijų valstybės kadastrui teikiamų saugomų teritorijų planavimo dokumentų (analoginių bei skaitmeninių duomenų) tikrinimo taisyklių aprašas
Priedas: Tikrinimo aktas
Gamtos paveldo objektų tvarkymo metodinės rekomendacijos, patvirtintos Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2020 m. sausio 21 d. įsakymu Nr. V-5 "Dėl gamtos paveldo objektų tvarkymo metodinių rekomendacijų patvirtinimo" (Valstybinės saugomų teritorijų tarybos prie Aplinkos ministerijos 2020 m gegužės 28 d. įsakymo Nr. V-28 redakcija).
Gamtos paveldo objektų schemų rengimo, registravimo ir apskaitos tvarkos aprašas, patvirtintas Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2020 m.lapkričio 6 d. įsakymu Nr. V-113 "Dėl gamtos paveldo objektų schemų rengimo, registravimo ir apskaitos tvarkos aprašo patvirtinimo"
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2020 m. kovo 13 d. įsakymu Nr. V-27 patvirtintas valstybės saugomų gamtos paveldo objektų, nepatenkančių į valstybinius gamtinius rezervatus, valstybinius parkus, valstybinius draustinius ar biosferos rezervatą, priskyrimo saugomų teritorijų direkcijoms, sąrašas.
Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos direktoriaus 2014 m. birželio 25 d. įsakymu Nr. V-148 patvirtinti Aukštaitijos, Dzūkijos, Kuršių nerijos, Žemaitijos nacionalinių parkų, Anykščių, Asvejos, Aukštadvario, Biržų, Dieveniškių istorinio, Dubysos, Gražutės, Kauno marių, Krekenavos, Kurtuvėnų, Labanoro, Metelių, Nemuno deltos, Nemuno kilpų, Neries, Pagramančio, Pajūrio, Panemunių, Rambyno, Salantų, Sartų, Sirvėtos, Tytuvėnų, Varnių, Veisiejų, Ventos, Vištyčio, Žagarės regioninių parkų, Čepkelių, Kamanų, Viešvilės valstybinių gamtinių rezervatų bei Žuvinto biosferos rezervato išskirtinės vertės aprašymai.